Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc94Q9D6J3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms