Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn4Q9D6I3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfn4Q9D6I3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms