Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms