Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc81Q9D5W4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms