Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930513O06RikQ9D549 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930513O06RikQ9D549 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930513O06RikQ9D549 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930513O06RikQ9D549 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930513O06RikQ9D549 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930513O06RikQ9D549 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930513O06RikQ9D549 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930513O06RikQ9D549 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930513O06RikQ9D549 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930513O06RikQ9D549 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930513O06RikQ9D549 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms