Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms