Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms