Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W5

Lrrc71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc71Q9D3W5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc71Q9D3W5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms