Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tchhl1Q9D3P1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tchhl1Q9D3P1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tchhl1Q9D3P1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms