Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hacd2Q9D3B1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms