Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D1K7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D1K7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D1K7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms