Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syf2Q9D198 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms