Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spc24Q9D083 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms