Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ssu72Q9CY97 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms