Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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