Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PmpcbQ9CXT8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms