Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pin4Q9CWW6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms