Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup37Q9CWU9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms