Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ly6kQ9CWP4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6kQ9CWP4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms