Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms