Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atxn3Q9CVD2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms