Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ska2Q9CR46 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ska2Q9CR46 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms