Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PclafQ9CQX4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PclafQ9CQX4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms