Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PompQ9CQT5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms