Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkn2Q9CQS6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkn2Q9CQS6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkn2Q9CQS6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn2Q9CQS6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms