Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc2Q9CQP2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trappc2Q9CQP2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trappc2Q9CQP2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trappc2Q9CQP2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trappc2Q9CQP2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trappc2Q9CQP2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2Q9CQP2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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