Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab5aQ9CQD1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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