Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQC3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQC3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQC3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9CQC3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9CQC3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9CQC3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQC3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms