Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms