Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsnaxip1Q99P25 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms