Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PccbQ99MN9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PccbQ99MN9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms