Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb2Q99LJ7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms