Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pagr1aQ99L02 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms