Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed9Q99KF1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed9Q99KF1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms