Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk3Q924C5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alpk3Q924C5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms