Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim7Q923T7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms