Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY5

Pcdhga3, Protocadherin gamma A3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga3Q91XY5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms