Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms