Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms