Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K8

Uncharacterized protein C1orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R2K8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8R2K8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8R2K8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8R2K8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8R2K8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R2K8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R2K8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q8R2K8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R2K8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R2K8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R2K8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R2K8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R2K8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8R2K8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8R2K8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8R2K8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q8R2K8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8R2K8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8R2K8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8R2K8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8R2K8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8R2K8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8R2K8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms