Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Rnf183Q8QZS5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Rnf183Q8QZS5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rnf183Q8QZS5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rnf183Q8QZS5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf183Q8QZS5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Rnf183Q8QZS5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rnf183Q8QZS5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rnf183Q8QZS5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Rnf183Q8QZS5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf183Q8QZS5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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