Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c1Q8K284 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms