Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1eQ8K202 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms