Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt33aQ8K0Y2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms