Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CopaQ8CIE6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms