Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHS2

Dnajc22, DnaJ homolog subfamily C member 22, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc22Q8CHS2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc22Q8CHS2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc22Q8CHS2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms