Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras1Q8CEC5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms