Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dclre1bQ8C7W7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms