Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a6Q8C6K9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Col6a6Q8C6K9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Col6a6Q8C6K9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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