Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apol7cQ8C6E1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7cQ8C6E1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms